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行業(yè)動態(tài)

卡脖子!mRNA疫苗質量控制中不可缺少的關鍵原料!

2021年2月24日,《MIT Technology Review》發(fā)布了“全球十大突破性技術”名單,其中榜首即是mRNA疫苗。

全球十大突破性技術榜首--mRNA疫苗


2021年2月24日,《MIT Technology Review》發(fā)布了“全球十大突破性技術”名單,其中榜首即是mRNA疫苗。從2019年12月新冠爆發(fā)到2022年4月1號,全球新冠確診已超4.8億。新冠病毒的蔓延促進了mRNA疫苗的發(fā)展。mRNA疫苗在新冠疫苗開發(fā)方面的成功,也促進了其在各種傳染病與腫瘤等治療方面廣闊的應用前景。

mRNA疫苗的生產(chǎn)流程包括序列設計、mRNA體外轉錄、體外修飾(加帽、加尾)、脂質體包被等過程。2020年發(fā)布的《預防用新型冠狀病毒mRNA疫苗藥學研究技術指導原則》中對mRNA的質量提出了一系列的要求,加帽率和加尾長度是其中最關鍵的2個指標。5’cap (5’帽)結構是翻譯起始所必須的結構,為核糖體識別mRNA提供信號,并協(xié)助核糖體與mRNA結合使翻譯從起始密碼子開始。3’poly(A)(3’尾)可以控制mRNA的穩(wěn)定性,以防降解,所以在mRNA合成修飾過程中,需要對5’加帽效率和3’poly(A)尾的分布進行監(jiān)控。

圖.mRNA的結構可以分為5個部分,

包含5cap,5UTR,ORF,3UTR和3’polyA。


疫苗mRNA因為長度較大,為幾千個核苷酸,而無法直接進行檢測,因此需要將5’ cap和3’ poly(A)端酶切成短片段,酶切之后5’ cap和3’ poly(A)均可以通過納米磁珠進行高通量、快速分離,這種納米磁珠通常粒徑在1-3μm之間。


5’cap端檢測流程

測定加帽效率主要是通過將5’cap端與生物素標記的引物退火,然后將5’cap端酶切成小片段,通過SA磁珠捕獲出biotin標記部分,然后將5’cap從磁珠表面洗脫,通過毛細管凝膠電泳或質譜法進行檢測(圖2)。

圖2. mRNA 5’帽子序列酶切,磁珠分離純化流程


3 PolyA尾分布檢測流程

3’ PolyA尾的檢測方法與5’加帽效率的檢測方法類似,需要通過酶切的方式獲得3’端的Poly A尾短鏈,然后利用Oligo dT磁珠分離純化,再分別進行毛細管電泳或質譜準確分析其長度分布(圖3)。

圖3. 3’ Poly(A)尾分布的檢測流程

在mRNA的5’端加帽效率和3’加尾分布的檢測過程中,都需要磁珠進行mRNA片段的富集。磁珠的性能影響到整個檢測數(shù)據(jù)的準確性和可靠性,該過程中的磁珠一般需要如下的特征:

a) 非特異性吸附低;

b) 靈敏度高,磁珠表面具有豐富的結合位點;

c) RNA易洗脫,磁珠表面需要特殊的封閉;

d) 耐受有機溶劑,部分操作會使用95%乙醇,對磁珠的溶劑耐受性有很大的要求。


磁珠推薦

BeaverBeads? Streptavidin 磁珠,表面共價修飾有大量的鏈霉親和素蛋白,可高效快速地結合生物素化抗體、核酸、蛋白等生物配體。

BeaverBeads? Oligo (dT)  磁珠,表面共價偶聯(lián) Oligo (dT),可與真核生物 mRNA 尾部的 Poly A 互補配對,可高效地從真核生物總 RNA 或直接從動植物組織或細胞裂解物中快速分離出完整、高純度的 mRNA。

分離得到的 mRNA 可用于多種分子生物學實驗:RT-PCR、 固相 cDNA 文庫構建、RACE、Northern 等。該類產(chǎn)品為超順磁性微球,可配套自動化設備進行高通量操作。

表1. BeaverBeads?  Streptavidin / Oligo (dT)產(chǎn)品性能


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供稿:王艷芝     |    修訂:彭穎靜 


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